Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 AC010976.1-210ENST00000630740 1005 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NTRK3Q16288 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 UBE2FP1-201ENST00000416536 447 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC012603.1-201ENST00000606424 528 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NTRK3Q16288 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms