Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTCYBP24-201ENST00000420387 1106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC087369.1-201ENST00000520775 996 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC099489.2-201ENST00000574976 260 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL109618.2-201ENST00000605527 211 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CNGA3Q16281 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.7 ms