Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 LNCPRESS2-201ENST00000502518 616 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AL590396.2-201ENST00000636511 1041 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SCN9AQ15858 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SCN9AQ15858 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
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