Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL031601.2-202ENST00000622650 282 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 HTN1-201ENST00000246896 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR5H14-201ENST00000437310 1080 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TSACC-207ENST00000470342 601 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR6C7P-201ENST00000547875 934 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
VAMP3Q15836 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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