Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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TAF1AQ15573 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 KLRC1-202ENST00000359151 1407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
TAF1AQ15573 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
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