Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC093840.1-201ENST00000511599 336 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC090602.1-201ENST00000469695 252 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC02389-201ENST00000535058 3546 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
PCOLCEQ15113 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms