Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL353764.1-201ENST00000442072 474 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC004777.1-201ENST00000624317 287 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC004160.1-201ENST00000625468 929 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010329.5-201ENST00000623497 2174 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC1.75□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010157.1-201ENST00000440589 527 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
SMCO1Q147U7 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
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