Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 CYCSP10-201ENST00000417973 294 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RPL12P20-201ENST00000475538 479 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC124068.1-201ENST00000563131 678 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms