Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL031121.1-201ENST00000406553 254 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.11□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU4-92P-201ENST00000363783 136 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
RFTN1Q14699 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms