Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
SMC1AQ14683 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RPS12P18-201ENST00000442381 270 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
SMC1AQ14683 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
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