Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RN7SL690P-201ENST00000582087 240 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 ADAM5-202ENST00000399789 1942 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 LINC01375-201ENST00000428485 1860 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MYO5A-209ENST00000553916 5989 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RNU6-1266P-201ENST00000362794 105 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 DUX4L52-201ENST00000549363 777 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SCARF1Q14162 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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