Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC00411-201ENST00000436722 461 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
CKAP5Q14008 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.5 ms