Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CDK13Q14004 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC013268.2-201ENST00000420753 337 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL731537.2-201ENST00000561565 951 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC234775.3-201ENST00000564612 656 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
CDK13Q14004 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.28□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 CALM1P2-201ENST00000452941 448 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CDK13Q14004 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms