Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SEPT2P1-201ENST00000419651 180 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL136360.1-201ENST00000503377 1900 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 NAA50-206ENST00000493454 964 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 SDHAF2-203ENST00000534878 523 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRR1Q13601 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
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