Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
ATRQ13535 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL359094.1-202ENST00000629917 1113 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
ATRQ13535 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
ATRQ13535 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
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