Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR5AS1-201ENST00000313555 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MAL2-201ENST00000522112 573 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC004453.1-201ENST00000487895 408 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
TOP3AQ13472 AC097103.1-201ENST00000512398 273 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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