Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FAM92A1P2-202ENST00000504766 877 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL590235.2-201ENST00000602641 632 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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TRAF3Q13114 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC006989.1-201ENST00000427212 131 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
TRAF3Q13114 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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