Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NR2F2-AS1-211ENST00000561402 589 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC032011.1-201ENST00000611703 1549 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MTND5P1-201ENST00000445440 1375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR325-201ENST00000385260 98 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
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