Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 STARD13-AS-221ENST00000608197 604 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FOXP2-206ENST00000393491 6085 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNA5SP120-201ENST00000410900 112 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 C11orf1-204ENST00000530214 599 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC005832.2-201ENST00000538921 1430 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 NBPF20-201ENST00000369373 18760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CHAF1AQ13111 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
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