Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
RBBP4Q09028 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.2 ms