Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AP002371.1-201ENST00000463604 433 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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PTPRMP28827 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
PTPRMP28827 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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PTPRMP28827 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
PTPRMP28827 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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