Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 AC242426.3-203ENST00000606757 712 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 MTND4P8-201ENST00000514997 1362 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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PTPRBP23467 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
PTPRBP23467 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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