Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MRPL42-203ENST00000547098 701 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 ANAPC10P1-201ENST00000395991 556 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
CRXO43186 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms