Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SNX13Q9Y5W8 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SNX13Q9Y5W8 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
SNX13Q9Y5W8 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SNX13Q9Y5W8 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SNX13Q9Y5W8 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SNX13Q9Y5W8 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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