Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SMG1Q96Q15 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SMG1Q96Q15 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
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