Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
TRIM63Q969Q1 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
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TRIM63Q969Q1 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC131571.1-201ENST00000429821 577 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MTND4LP5-201ENST00000605152 292 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 OR2L13-201ENST00000358120 1942 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 LINC02020-202ENST00000421006 575 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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TRIM63Q969Q1 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SNHG1-210ENST00000539303 240 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TRIM63Q969Q1 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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