Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.4-201ENST00000605279 254 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC062032.1-201ENST00000436245 355 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 OR10A7-201ENST00000326258 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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BBS9Q3SYG4 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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BBS9Q3SYG4 RNU6-123P-201ENST00000516163 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
BBS9Q3SYG4 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
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