Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL7P2-201ENST00000427639 268 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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CCDC142Q17RM4 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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CCDC142Q17RM4 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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CCDC142Q17RM4 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
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CCDC142Q17RM4 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
CCDC142Q17RM4 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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