Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 MECOM-203ENST00000460814 3374 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PTPRNQ16849 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PTPRNQ16849 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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