Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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PTPROQ16827 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 DUXAP2-201ENST00000519198 589 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
PTPROQ16827 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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