Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
CCDC85BQ15834 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC138965.3-201ENST00000623875 498 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TBC1D23-201ENST00000344949 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SKP153-201ENST00000365026 316 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
CCDC85BQ15834 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms