Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RN7SKP132-201ENST00000516001 208 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CHRNA6Q15825 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.97
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