Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AL590396.4-201ENST00000636779 956 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SHHQ15465 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.97
SHHQ15465 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC010976.1-211ENST00000454503 644 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHHQ15465 PLCXD2-AS1-201ENST00000493131 491 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHHQ15465 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHHQ15465 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHHQ15465 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHHQ15465 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
SHHQ15465 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
SHHQ15465 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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