Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC012593.1-211ENST00000625996 799 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC067945.3-201ENST00000456176 386 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
RAB35Q15286 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms