Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
R3HDM1Q15032 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms