Protein–RNA interactions for Protein: Q15011

HERPUD1, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 1 protein, humanhuman

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD1Q15011 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ELOCP32-201ENST00000548625 324 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
HERPUD1Q15011 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
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