Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 API5P2-201ENST00000397055 1498 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC099792.1-203ENST00000634701 2183 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RNU6-329P-201ENST00000459618 107 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NCAPHQ15003 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111 ms