Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 PABPC1P3-201ENST00000469174 459 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
GPNMBQ14956 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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GPNMBQ14956 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
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GPNMBQ14956 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
GPNMBQ14956 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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