Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SATB1-AS1-227ENST00000625533 743 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SFR1P1-201ENST00000403720 688 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AP003385.6-201ENST00000531603 374 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHD4Q14839 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNU6-272P-201ENST00000411028 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO1P3-201ENST00000429327 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL365273.2-201ENST00000491114 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
CHD4Q14839 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms