Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL589994.2-201ENST00000621124 579 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 NDUFS5P1-201ENST00000405668 289 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC105129.1-201ENST00000560250 297 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RNA5SP388-201ENST00000362584 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
TRIM25Q14258 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.2 ms