Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 POU6F2-AS1-201ENST00000433519 381 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL445669.1-201ENST00000426743 755 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CUL4AQ13619 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms