Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
NAE1Q13564 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC3.53□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
NAE1Q13564 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
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