Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 STAP1-202ENST00000396225 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC112196.1-201ENST00000515092 832 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZNF12-203ENST00000404360 4474 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNMT-209ENST00000592764 4108 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.1 ms