Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ADGRL2-207ENST00000370723 5254 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AL162730.1-201ENST00000605734 292 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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SF3B2Q13435 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
SF3B2Q13435 AC012186.2-201ENST00000569353 321 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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