Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC026790.2-201ENST00000606282 430 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.53□□□□□ -2
XRCC4Q13426 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC098826.1-201ENST00000433943 471 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC117377.1-201ENST00000547633 1038 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC091059.1-201ENST00000585190 215 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
XRCC4Q13426 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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