Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL161756.2-201ENST00000604597 246 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 CR392039.5-201ENST00000623201 510 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MAPK10-353ENST00000641803 8483 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 YME1L1P1-201ENST00000429435 297 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PDE3BQ13370 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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