Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 SRP72-202ENST00000504757 745 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AP000790.1-201ENST00000528891 737 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AP000676.4-201ENST00000624659 623 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC005772.1-201ENST00000446671 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.98
PRDM2Q13029 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.65□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms