Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 NRK-201ENST00000243300 8062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 BCL2L14-201ENST00000266434 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 DBT-202ENST00000370132 10799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 OR4D5-201ENST00000307033 1095 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
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FOXC1Q12948 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
FOXC1Q12948 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
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