Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL451054.2-201ENST00000420896 202 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC020914.4-201ENST00000597690 277 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SEC31A-203ENST00000348405 4012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU6-641P-201ENST00000384006 107 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC022690.1-201ENST00000526681 550 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
FOXO1Q12778 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms