Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 CLHC1-203ENST00000406076 1777 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRAP18433 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
PTPRAP18433 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
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PTPRAP18433 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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PTPRAP18433 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PTPRAP18433 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
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